В систему образования Хотимского района входит: 8 учреждений общего среднего образования (4 средние школы и 4 учебно-педагогических комплексов сад-школа), 5 учреждений дошкольного образования, Центр творчества детей и молодежи, Центр коррекционно-развивающего обучения и реабилитации, социально-педагогический центр.

Также в районе открыт: Отдел туризма и краеведения районного центра творчества детей и молодежи. Координирует работу системы образования района отдел по образованию, спорту и туризму райисполкома, который является структурным подразделением Хотимского районного исполнительного комитета.